Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpusd3Q14AI6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpusd3Q14AI6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms