Protein–RNA interactions for Protein: Q0WXH6

Gm7030, MHC class Ib T9, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7030Q0WXH6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm7030Q0WXH6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm7030Q0WXH6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm7030Q0WXH6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms