Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBB0

Prelid2, PRELI domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid2Q0VBB0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prelid2Q0VBB0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prelid2Q0VBB0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prelid2Q0VBB0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prelid2Q0VBB0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prelid2Q0VBB0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prelid2Q0VBB0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prelid2Q0VBB0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prelid2Q0VBB0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prelid2Q0VBB0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prelid2Q0VBB0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prelid2Q0VBB0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prelid2Q0VBB0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms