Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurl1bQ0MW30 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms