Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnma1Q08460 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnma1Q08460 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms