Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Calb2Q08331 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Calb2Q08331 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms