Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ebf1Q07802 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ebf1Q07802 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms