Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NrepQ07475 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NrepQ07475 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NrepQ07475 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NrepQ07475 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms