Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cntn3Q07409 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Cntn3Q07409 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms