Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scg2Q03517 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scg2Q03517 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scg2Q03517 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms