Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Msx2Q03358 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Msx2Q03358 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms