Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snai1Q02085 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snai1Q02085 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms