Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmmrQ00547 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms