Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gbp10Q000W5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbp10Q000W5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbp10Q000W5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms