Protein–RNA interactions for Protein: P99025

Gchfr, GTP cyclohydrolase 1 feedback regulatory protein, mousemouse

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GchfrP99025 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GchfrP99025 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GchfrP99025 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GchfrP99025 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GchfrP99025 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GchfrP99025 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GchfrP99025 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GchfrP99025 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms