Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn1bP97952 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms