Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab33aP97950 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms