Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitx2P97474 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms