Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frg1P97376 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frg1P97376 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frg1P97376 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frg1P97376 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frg1P97376 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frg1P97376 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frg1P97376 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frg1P97376 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frg1P97376 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frg1P97376 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frg1P97376 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frg1P97376 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg1P97376 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frg1P97376 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frg1P97376 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Frg1P97376 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frg1P97376 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frg1P97376 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frg1P97376 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Frg1P97376 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms