Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp1b3P97370 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1b3P97370 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.7 ms