Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx1P80205 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx1P80205 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx1P80205 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx1P80205 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx1P80205 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx1P80205 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otx1P80205 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx1P80205 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx1P80205 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx1P80205 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx1P80205 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms