Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprvP70289 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprvP70289 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprvP70289 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprvP70289 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprvP70289 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprvP70289 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprvP70289 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprvP70289 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprvP70289 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprvP70289 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprvP70289 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprvP70289 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprvP70289 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprvP70289 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprvP70289 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprvP70289 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprvP70289 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PtprvP70289 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprvP70289 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprvP70289 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprvP70289 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprvP70289 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprvP70289 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprvP70289 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprvP70289 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprvP70289 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms