Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf6P70279 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf6P70279 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Surf6P70279 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf6P70279 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf6P70279 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Surf6P70279 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms