Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stra8P70278 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Stra8P70278 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Stra8P70278 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Stra8P70278 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stra8P70278 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stra8P70278 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stra8P70278 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Stra8P70278 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stra8P70278 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms