Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf5P70191 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf5P70191 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf5P70191 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf5P70191 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf5P70191 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf5P70191 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf5P70191 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf5P70191 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf5P70191 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Traf5P70191 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Traf5P70191 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf5P70191 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf5P70191 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf5P70191 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf5P70191 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf5P70191 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf5P70191 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms