Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta1P68134 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Acta1P68134 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta1P68134 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta1P68134 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta1P68134 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta1P68134 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta1P68134 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta1P68134 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Acta1P68134 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta1P68134 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms