Protein–RNA interactions for Protein: P68037

Ube2l3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2l3P68037 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2l3P68037 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms