Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Barhl1P63157 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Barhl1P63157 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms