Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp2P63044 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms