Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps27aP62983 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms