Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps28P62858 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps28P62858 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rps28P62858 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms