Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snrpd2P62317 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd2P62317 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd2P62317 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd2P62317 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd2P62317 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd2P62317 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd2P62317 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd2P62317 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd2P62317 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms