Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan5P62080 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tspan5P62080 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms