Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfia3P60469 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms