Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CgnP59242 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CgnP59242 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CgnP59242 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CgnP59242 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CgnP59242 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CgnP59242 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CgnP59242 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CgnP59242 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CgnP59242 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CgnP59242 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CgnP59242 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CgnP59242 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CgnP59242 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CgnP59242 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CgnP59242 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CgnP59242 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CgnP59242 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CgnP59242 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CgnP59242 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CgnP59242 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CgnP59242 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CgnP59242 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CgnP59242 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CgnP59242 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CgnP59242 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CgnP59242 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CgnP59242 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CgnP59242 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CgnP59242 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CgnP59242 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CgnP59242 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CgnP59242 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CgnP59242 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CgnP59242 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CgnP59242 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CgnP59242 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CgnP59242 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CgnP59242 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CgnP59242 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CgnP59242 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CgnP59242 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CgnP59242 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CgnP59242 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CgnP59242 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CgnP59242 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CgnP59242 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CgnP59242 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CgnP59242 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CgnP59242 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CgnP59242 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CgnP59242 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CgnP59242 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CgnP59242 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CgnP59242 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CgnP59242 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CgnP59242 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CgnP59242 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CgnP59242 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CgnP59242 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CgnP59242 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CgnP59242 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CgnP59242 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CgnP59242 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CgnP59242 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CgnP59242 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CgnP59242 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CgnP59242 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CgnP59242 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CgnP59242 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CgnP59242 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CgnP59242 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CgnP59242 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CgnP59242 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CgnP59242 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CgnP59242 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CgnP59242 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CgnP59242 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CgnP59242 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CgnP59242 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CgnP59242 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CgnP59242 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CgnP59242 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CgnP59242 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CgnP59242 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CgnP59242 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CgnP59242 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CgnP59242 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CgnP59242 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CgnP59242 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CgnP59242 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CgnP59242 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CgnP59242 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CgnP59242 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CgnP59242 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CgnP59242 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CgnP59242 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CgnP59242 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CgnP59242 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CgnP59242 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms