Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Senp1P59110 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Senp1P59110 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Senp1P59110 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Senp1P59110 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Senp1P59110 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Senp1P59110 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Senp1P59110 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Senp1P59110 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Senp1P59110 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Senp1P59110 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Senp1P59110 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Senp1P59110 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Senp1P59110 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Senp1P59110 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Senp1P59110 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Senp1P59110 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Senp1P59110 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Senp1P59110 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Senp1P59110 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Senp1P59110 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp1P59110 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp1P59110 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Senp1P59110 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Senp1P59110 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Senp1P59110 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Senp1P59110 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms