Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpm2P58774 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms