Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp1P58466 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms