Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp20P57748 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp20P57748 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms