Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GferP56213 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GferP56213 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GferP56213 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GferP56213 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GferP56213 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GferP56213 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GferP56213 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GferP56213 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GferP56213 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GferP56213 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GferP56213 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GferP56213 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GferP56213 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GferP56213 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GferP56213 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GferP56213 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GferP56213 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GferP56213 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GferP56213 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GferP56213 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GferP56213 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GferP56213 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GferP56213 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GferP56213 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GferP56213 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GferP56213 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GferP56213 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GferP56213 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GferP56213 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GferP56213 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GferP56213 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GferP56213 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GferP56213 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GferP56213 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GferP56213 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GferP56213 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GferP56213 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GferP56213 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GferP56213 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GferP56213 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GferP56213 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GferP56213 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GferP56213 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GferP56213 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GferP56213 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GferP56213 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GferP56213 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GferP56213 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GferP56213 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GferP56213 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GferP56213 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GferP56213 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GferP56213 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GferP56213 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GferP56213 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GferP56213 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GferP56213 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GferP56213 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GferP56213 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GferP56213 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GferP56213 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GferP56213 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GferP56213 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GferP56213 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GferP56213 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GferP56213 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GferP56213 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GferP56213 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GferP56213 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GferP56213 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GferP56213 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GferP56213 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GferP56213 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GferP56213 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GferP56213 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GferP56213 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GferP56213 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GferP56213 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GferP56213 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GferP56213 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GferP56213 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GferP56213 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GferP56213 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GferP56213 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GferP56213 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GferP56213 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GferP56213 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GferP56213 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GferP56213 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GferP56213 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GferP56213 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GferP56213 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GferP56213 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GferP56213 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GferP56213 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GferP56213 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GferP56213 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GferP56213 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GferP56213 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms