Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp10P52479 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp10P52479 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp10P52479 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp10P52479 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp10P52479 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp10P52479 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp10P52479 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp10P52479 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp10P52479 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp10P52479 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp10P52479 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp10P52479 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp10P52479 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp10P52479 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp10P52479 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp10P52479 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp10P52479 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp10P52479 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp10P52479 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp10P52479 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp10P52479 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp10P52479 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp10P52479 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp10P52479 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp10P52479 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp10P52479 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp10P52479 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp10P52479 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp10P52479 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp10P52479 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Usp10P52479 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp10P52479 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp10P52479 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms