Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccr4P51680 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms