Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TspoP50637 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TspoP50637 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TspoP50637 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TspoP50637 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TspoP50637 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TspoP50637 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TspoP50637 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TspoP50637 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TspoP50637 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TspoP50637 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TspoP50637 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TspoP50637 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TspoP50637 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TspoP50637 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TspoP50637 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TspoP50637 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TspoP50637 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TspoP50637 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TspoP50637 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TspoP50637 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TspoP50637 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TspoP50637 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TspoP50637 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TspoP50637 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TspoP50637 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TspoP50637 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TspoP50637 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TspoP50637 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TspoP50637 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TspoP50637 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TspoP50637 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TspoP50637 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TspoP50637 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TspoP50637 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TspoP50637 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TspoP50637 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TspoP50637 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TspoP50637 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TspoP50637 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TspoP50637 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TspoP50637 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TspoP50637 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TspoP50637 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TspoP50637 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TspoP50637 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TspoP50637 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TspoP50637 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TspoP50637 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TspoP50637 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TspoP50637 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TspoP50637 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TspoP50637 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TspoP50637 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TspoP50637 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TspoP50637 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TspoP50637 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TspoP50637 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TspoP50637 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TspoP50637 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TspoP50637 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TspoP50637 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TspoP50637 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TspoP50637 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TspoP50637 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TspoP50637 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TspoP50637 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TspoP50637 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TspoP50637 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TspoP50637 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TspoP50637 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TspoP50637 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TspoP50637 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TspoP50637 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TspoP50637 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TspoP50637 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TspoP50637 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TspoP50637 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TspoP50637 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TspoP50637 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TspoP50637 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TspoP50637 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TspoP50637 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TspoP50637 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TspoP50637 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TspoP50637 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TspoP50637 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TspoP50637 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TspoP50637 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TspoP50637 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TspoP50637 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TspoP50637 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TspoP50637 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TspoP50637 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TspoP50637 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TspoP50637 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TspoP50637 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TspoP50637 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TspoP50637 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TspoP50637 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms