Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpreP49446 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpreP49446 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtpreP49446 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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