Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syt1P46096 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syt1P46096 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syt1P46096 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syt1P46096 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Syt1P46096 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syt1P46096 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syt1P46096 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syt1P46096 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Syt1P46096 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syt1P46096 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Syt1P46096 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syt1P46096 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syt1P46096 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syt1P46096 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syt1P46096 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms