Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx1-2P42580 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms