Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csf3rP40223 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms