Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprkP35822 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprkP35822 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprkP35822 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PtprkP35822 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PtprkP35822 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PtprkP35822 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PtprkP35822 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PtprkP35822 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PtprkP35822 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PtprkP35822 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprkP35822 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PtprkP35822 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PtprkP35822 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PtprkP35822 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PtprkP35822 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprkP35822 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms