Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rfc1P35601 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rfc1P35601 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms