Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab17P35292 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab17P35292 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab17P35292 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab17P35292 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab17P35292 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab17P35292 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab17P35292 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms